Sari la conținut

Institutul Sanger

De la Wikipedia, enciclopedia liberă
Institutul Sanger al Trustului Wellcome
Informații
Fondată1992
Localizare
Țara Regatul Unit
South Cambridgeshire  Modificați la Wikidata
OrașHinxton
Coordonate52°04′39″N 0°11′15″E ({{PAGENAME}}) / 52.0775°N 0.1875°E
CampusWellcome Trust Genome Campus
Conducere
DirectorProfessor Sir Michael Stratton
Cifre cheie
Angajați900
Corp didactic37
Cercetători~900
Alte informații
AfiliereUniversitatea Cambridge
Prezență web
www.sanger.ac.uk

Institutul Sanger, aparținând Trustului Wellcome este o organizație britanică non-profit, axată pe cercetarea în domeniul geneticii. A fost fondată de Trustul Wellcome.[1]

Institutul Sanger se află în Wellcome Trust Genome Campus, lângă satul Hinxton, în apropiere de Cambridge, Marea Britanie. În același campus se află și Institutul European de Bioinformatică. A fost înființat în 1992 sub numele de Centrul Sanger, numit așa după dublul laureat al premiului Nobel Frederick Sanger.[2][3] A fost inițial un centru de dimensiuni mari dedicat secvențierii ADN și a participat în Proiectul „Genomul uman”.

Institutul Sanger a avut cea mai mare contribuție unitară la secvențierea genomului uman. De la înființarea sa, institutul duce o politică de data sharing, iar majoritatea proiectelor de cercetare sunt făcute în colaborare cu alte instituții.

Începând cu anul 2000, institutul are ca misiune și înțelegerea rolului geneticii în stările de sănătate și boală.[4] Institutul are în prezent aproximativ 900 de angajați, care lucrează în patru mari arii de studiu: genetica umană, genetica agenților patogeni, genetica șoarecilor și bioinformatica.

Facililități și resurse

[modificare | modificare sursă]
Wellcome Trust Genome Campus
Vitraliu comemorativ din clădirea Sulston a Institutului Sanger

"Campusul ADN-ului" (Genome campus) al Trustului Wellcome are aproximativ 1300 de angajați, 900 lucrând pentru Institutul Sanger, iar restul lucrând în Institutul European de Bioinformatică și alte companii mai mici.

Angajații Institutului Sanger lucrează săptămânal cu milioane de mostre de ADN. Institutul folosește tehnologie de ultimă oră pentru a răspunde la întrebări care până acum câțiva ani nu aveau răspuns. [5] Datorită progreselor tehnologiei, Institutul Sanger secvențiază genomurile oamenilor, a altor specii vertebrate și a agenților patogeni, în ritm tot mai mare, și la prețuri tot mai mici. Institutul Sanger secvențiază aproximatix 10 miliarde de baze azotate în fiecare zi. [6]

Resurse științifice

[modificare | modificare sursă]

Principalele rezultate ale programelor de cercetare de la Institutul Sanger sunt bazele de date care conțin informații din biologie. Bazele de date întreținute de Institutul Sanger sunt:

Clădirea Morgan (în dreapta), parte a Institutului Sanger

Începând cu anul 2000, Institutul Sanger a investit în secvențiere și a creat noi programe pentru biologia postgenomică - înțelegerea mesajelor din gene . Institutul este implicat în diferite arii de cercetare:

Genetica umană

[modificare | modificare sursă]

Institutul se axează pe caracterizarea variației genetice a oamenilor. Pe lângă contribuția la Proiectul „Genomul uman”, cercetătorii de la Institutul Sanger au contribuit la diverse studii legate de îmbolnăvire, genetică comparativă și genetică evolutivă. În ianuarie 2008, lansarea Proiectului celor 1000 de genomuri , proiect la care au colaborat cercetători din toată lumea, a semnalat efortul de a secvenția 1000 de indivizi cu scopul de a crea "cea mai detaliată hartă a variației genetice cu scopul de a înțelege studiile despre îmbolnăvire" .[17] Datele rezultate din proiectele-pilot sunt accesibile gratuit începând cu iunie 2010. [18] În anul 2010, Institutul Sanger și-a anunțat participarea la proiectul UK10K ,[19][20][21] care are ca scop secvențierea genomurilor a 10.000 de indivizi, pentru a identifica variații genetice rare și efectele lor asupra sănătății oamenilor. Institutul Sanger este de asemenea membru al International Cancer Genome Consortium, un proiect internațional care are ca scop descrierea diferitelor tipuri de tumori. [22] De asemenea, Institutul Sanger este membru al programelor de cercetare GENCODE și ENCODE [23] care au ca scop crearea unei enciclopedii a elementelor ADN. [necesită citare]

Organisme de referință

[modificare | modificare sursă]

Programele dedicate geneticii șoarecilor și peștilor folosesc secvențele ADN ale acestor organisme de referință pentru a înțelege mecanisme biologice elementare și funcțiile genelor umane. Proiectele includ studiul dezvoltării, cancerului și comportamentului.

Genetica organismelor patogene

[modificare | modificare sursă]

Institutul studiază efectele variației genetice în interactiunea dintre gazdă și organismele patogene. Cercetarea de la Institutul Sanger include multe bacterii, viruși și alte organisme patogene.

Bioinformatică

[modificare | modificare sursă]

Echipele de bioinformatică de la Institutul Sanger au dezvoltat sisteme IT pentru secvențiere în cercetarea postgenomică. Institutul dezvoltă și menține unelte informatice dedicate analizei ADN, ARN, proteinelor. Cercetătorii din toată lumea pot accesa aceste resurse gratuit pentru a dobândi noi cunoștințe, prin analize asistate de calculator și integrarea datelor.

Programele doctorale și postdoctorale

[modificare | modificare sursă]

Institutul are două programe doctorale: un program de 4 ani pentru studenții cu diplomă de licență în șiințe și un program de 3 ani pentru cei diplomă de medici. Programul de 4 ani permite studenților să lucreze în 3 laboratoare diferite pentru a-și lărgi cunoștințele științifice, înaintea începerii programului de doctorat propriu-zis. Fiecare student trebuie șă-și aleagă cel puțin un proiect experimental și cel puțin unul de informatică. [24]

Institutul are aproximativ 50 de studenți la studiile de licență, toți fiind înregistrați la Universitatea Cambridge.[25]

  1. ^ „MRC Centre United Kingdom: Wellcome Trust Sanger Institute”. Medical Research Council. Arhivat din original la . Accesat în . 
  2. ^ PMID 24380948 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  3. ^ doi:10.1146/annurev.bi.57.070188.000245
    Această referință va fi completată automat în următoarele minute. Puteți sări peste perioada de așteptare sau puteți extinde citarea manual
  4. ^ „Wellcome Trust Sanger Institute - About us”. Wellcome Trust Sanger Institute. Accesat în . 
  5. ^ „Wellcome Trust Sanger Institute - Sequencing”. Wellcome Trust Sanger Institute. Arhivat din original la . Accesat în . 
  6. ^ Jones, I. „Feature: Highly cited”. Wellcome Trust. Arhivat din original la . Accesat în . 
  7. ^ PMID 25355519 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  8. ^ PMID 24150940 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  9. ^ PMID 25352552 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  10. ^ PMID 22116062 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  11. ^ PMID 24157837 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  12. ^ PMID 24288371 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  13. ^ PMID 25392425 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  14. ^ PMID 24194607 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  15. ^ PMID 18003653 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  16. ^ PMID 24194605 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  17. ^ „1000 Genomes: A Deep Catalog of Human Genetic Variation”. 1000 Genomes Project. Arhivat din original la . Accesat în . 
  18. ^ „1000 Genomes Project releases data from pilot projects on path to providing database for 2,500 human genomes”. Wellcome Trust Sanger Institute. Arhivat din original la . Accesat în . 
  19. ^ PMID 24424120 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  20. ^ PMID 24229443 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  21. ^ „Wellcome Trust launches study of 10,000 human genomes in UK”. Wellcome Trust Sanger Institute. Arhivat din original la . Accesat în . 
  22. ^ „International Cancer Genome Consortium Homepage”. International Cancer Genome Consortium. Accesat în . 
  23. ^ „Wellcome Trust Sanger Institute - ENCODE and GENCODE”. Accesat în . 
  24. ^ „Wellcome Trust Sanger Institute PhD Programmes”. Wellcome Trust Sanger Institute. Accesat în . 
  25. ^ „Sanger PhD and MPhil theses”. Arhivat din original la .