Institutul Sanger: Diferență între versiuni

De la Wikipedia, enciclopedia liberă
Navighează interactiv prin istoric
← Diferența anterioarăDiferența următoare →
Conținut șters Conținut adăugat
VizualWikitext
Fără descriere a modificării
Fără descriere a modificării
Linia 57: Linia 57:
De la înființarea sa, institutul duce o politică de ''data sharing'', iar majoritatea proiectelor de cercetare sunt făcute în colaborare cu alte instituții.
De la înființarea sa, institutul duce o politică de ''data sharing'', iar majoritatea proiectelor de cercetare sunt făcute în colaborare cu alte instituții.


Începând cu anul 2000, institutul are ca misiunea și înțelegerea rolului geneticii în stărilor de sănătate și boală.<ref>
Începând cu anul 2000, institutul are ca misiunea și înțelegerea rolului geneticii în stările de sănătate și boală.<ref>
{{cite web
{{cite web
| url = http://www.sanger.ac.uk/about/
| url = http://www.sanger.ac.uk/about/
Linia 64: Linia 64:
| accessdate = 2010-06-28
| accessdate = 2010-06-28
}}</ref>
}}</ref>
Institutul are în prezent aproximativ 900 de angajați, care lucrează în patru mari arii de studiu: genetica umană, genetica agenților patogeni, genetica șoarecilor și bioinformatica.
Institutul are în prezent aproximativ 900 de angajați, care lucrează în patru mari arii de studiu: genetica umană, genetica agenților patogeni, genetica șoarecilor și [[bioinformatica]].
The Institute now employs around 900 people and engages in four main areas of research: Human genetics, pathogen genetics, mouse and zebrafish genetics and [[bioinformatică]].


==Facililități și resurse==
==Facililități și resurse==
Linia 78: Linia 77:


Angajații Institutului Sanger lucrează săptămânal cu milioane de mostre de ADN. Institutul folosește tehnologie de ultimă oră pentru a răspunde la întrebări care până acum câțiva ani nu aveau răspuns. <ref>{{cite web|url= http://www.sanger.ac.uk/resources/technologies/sequencing.html|title=Wellcome Trust Sanger Institute - Sequencing|publisher=Wellcome Trust Sanger Institute|accessdate=2010-06-28}}</ref> Datorită progreselor tehnologiei, Institutul Sanger secvențiază genomurile oamenilor, a altor specii vertebrate și a agenților patogeni, în ritm tot mai mare, și la prețuri tot mai mici. Institutul Sanger secvențiază aproximatix 10 miliarde de [[bază azotată | baze azotate]] în fiecare zi. <ref>{{cite web|url=http://www.wellcome.ac.uk/News/2008/Features/WTX052290.htm|author=Jones, I|title=Feature: Highly cited|publisher=Wellcome Trust|accessdate=2009-01-22}}</ref>
Angajații Institutului Sanger lucrează săptămânal cu milioane de mostre de ADN. Institutul folosește tehnologie de ultimă oră pentru a răspunde la întrebări care până acum câțiva ani nu aveau răspuns. <ref>{{cite web|url= http://www.sanger.ac.uk/resources/technologies/sequencing.html|title=Wellcome Trust Sanger Institute - Sequencing|publisher=Wellcome Trust Sanger Institute|accessdate=2010-06-28}}</ref> Datorită progreselor tehnologiei, Institutul Sanger secvențiază genomurile oamenilor, a altor specii vertebrate și a agenților patogeni, în ritm tot mai mare, și la prețuri tot mai mici. Institutul Sanger secvențiază aproximatix 10 miliarde de [[bază azotată | baze azotate]] în fiecare zi. <ref>{{cite web|url=http://www.wellcome.ac.uk/News/2008/Features/WTX052290.htm|author=Jones, I|title=Feature: Highly cited|publisher=Wellcome Trust|accessdate=2009-01-22}}</ref>

===Resurse științifice===

Principalele rezultate ale programelor de cercetare de la Institutul Sanger sunt bazele de date care conțin informații din biologie. Bazele de date întreținute de Institutul Sanger sunt:

* [[COSMIC cancer database|COSMIC]],<ref>{{cite pmid| 25355519 |noedit}}</ref> un catalog al mutațiilor somatice ale [[cancer | cancerului ]]
* [[DECIPHER]],<ref name=decipher/> o bază de date a dezechilibrelor cromozomiale ale oamenilor, folosind resurse Ensembl
* [[Ensembl]],<ref>{{cite pmid|25352552|noedit}}</ref> un browser de genomuri, găzduit împreună cu [[Institutul European de Bioinformatică]]
* GeneDB,<ref>{{cite pmid| 22116062|noedit}}</ref> o bază de date dedicată agenților patogeni
* [[MEROPS]],<ref>{{cite pmid| 24157837|noedit}}</ref> bază de date a peptidazelor
* [[Mouse Genetics Project]], o bază de date care conține analiza fenotipică a sute de șoareci mutanți
* [[Pfam]],<ref>{{cite pmid| 24288371|noedit}}</ref> o bază de date dedicată famiilor de proteine
* [[Rfam]],<ref>{{cite pmid| 25392425|noedit}}</ref> o bază de date dedicată famiilor de ARN
* [[TreeFam]],<ref>{{cite pmid| 24194607|noedit}}</ref> o bază de date a arborilor [[ Filogenie | filogenetici ]] a genelor animale
* [[Vertebrate and Genome Annotation Project|Vega]],<ref>{{cite pmid| 18003653|noedit}}</ref> o unealtă pentru anotarea genomurilor animalelor vertebrate
* [[WormBase]],<ref>{{cite pmid| 24194605|noedit}}</ref> o bază de date dedicată c ''[[Caenorhabditis elegans|C. elegans]]'' și altor viermi

== Cercetare ==
[[File:Hinxton hall.jpg|thumb|right|300px|Clădirea Morgan (în dreapta), parte a Institutului Sanger]]
Începând cu anul 2000, Institutul Sanger a investit în secvențiere și a creat noi programe pentru biologia postgenomică - înțelegerea mesajelor din [[genă | gene ]]. Institutul este implicat în diferite arii de cercetare:

=== Genetica umană===

Institutul se axează pe caracterizarea variației genetice a oamenilor. Pe lângă contribuția la [[Proiectul „Genomul uman”]], cercetătorii de la Institutul Sanger au contribuit la diverse studii legate de îmbolnăvire, genetică comparativă și genetică evolutivă. În ianuarie 2008, lansarea [[Proiectul celor 1000 de genomuri | Proiectului celor 1000 de genomuri ]], proiect la care au colaborat cercetători din toată lumea, a semnalat efortul de a secvenția 1000 de indivizi cu scopul de a crea "cea mai detaliată hartă a variației genetice cu scopul de a înțelege studiile despre îmbolnăvire" .<ref>{{cite web|url=http://www.1000genomes.org/page.php|title=1000 Genomes: A Deep Catalog of Human Genetic Variation|publisher=1000 Genomes Project|accessdate=2008-12-22}}</ref> Datele rezultate din proiectele-pilot sunt accesibile gratuit începând cu iunie 2010. <ref>{{cite web|url=http://www.sanger.ac.uk/about/press/2010/100621.html|title=1000 Genomes Project releases data from pilot projects on path to providing database for 2,500 human genomes|publisher=Wellcome Trust Sanger Institute|accessdate=2010-06-28}}</ref>
În anul 2010, Institutul Sanger și-a anunțat participarea la proiectul UK10K ,<ref>{{cite pmid|24424120|noedit}}</ref><ref>{{cite pmid|24229443|noedit}}</ref><ref>{{cite web|url=http://www.sanger.ac.uk/about/press/2010/100624-uk10k.html|title=Wellcome Trust launches study of 10,000 human genomes in UK|publisher=Wellcome Trust Sanger Institute|accessdate=2010-06-28}}</ref> care are ca scop secvențierea genomurilor a 10.000 de indivizi, pentru a identifica variații genetice rare și efectele lor asupra sănătății oamenilor. Institutul Sanger este de asemenea membru al [[International Cancer Genome Consortium]], un proiect internațional care are ca scop descrierea diferitelor tipuri de tumori.
<ref>{{cite web|url=http://www.icgc.org/|title=International Cancer Genome Consortium Homepage|publisher=International Cancer Genome Consortium|accessdate=2009-01-23}}</ref>
De asemenea, Institutul Sanger este membru al programelor de cercetare [[GENCODE]] și [[ENCODE]] <ref>{{cite web|url=http://www.sanger.ac.uk/resources/databases/encode//|title=Wellcome Trust Sanger Institute - ENCODE and GENCODE|accessdate=2010-06-28}}</ref> care au ca scop crearea unei enciclopedii a elementelor ADN. {{citation needed|date=April 2015}}

=== Organisme de referință ===
Programele dedicate geneticii șoarecilor și peștilor folosesc secvențele ADN ale acestor [[organisme de referință]] pentru a înțelege mecanisme biologice elementare și funcțiile genelor umane. Proiectele includ studiul dezvoltării, cancerului și comportamentului.

=== Genetica organismelor patogene===

Institutul studiză efectele variației genetice în interactiunea dintre gazdă și organismele patogene.
Cercetarea de la Institutul Sanger include multe bacterii, viruși și alte organisme patogene.

=== Bioinformatică ===
Echipele de bioinformatică de la Institutul Sanger au dezvoltat sisteme IT pentru secvențiere în cercetarea postgenomică. Institutul dezvoltă și menține unelte informatice dedicate analizei ADN, ARN, proteinelor. Cercetătorii din toată lumea pot accesa aceste resurse gratuit pentru a dobândi noi cunoștințe, prin analize asistate de calculator și integrarea datelor.

=== Programele doctorale și postdoctorale ===

Institutul are două programe doctorale: un program de 4 ani pentru studenții cu diplomă de licență în șiințe și un program de 3 ani pentru cei diplomă de medici. Programul de 4 ani permite studenților să lucreze în 3 laboratoare diferite pentru a-și lărgi cunoștințele științifice, înaintea începerii programului de doctorat propriu-zis. Fiecare student trebuie șă-și aleagă cel puțin un proiect experimental și cel puțin unul de informatică.
<ref>
{{cite web
| url = http://www.sanger.ac.uk/careers/phd/
| title = Wellcome Trust Sanger Institute PhD Programmes
| publisher = Wellcome Trust Sanger Institute
| accessdate = 2009-11-13
}}</ref>

Institutul are aproximativ 50 de studenți la studiile de licență, iar toți sunt înregistrați la [[Universitatea Cambridge]].<ref>{{cite web|archiveurl=https://web.archive.org/web/20150407104250/http://www.sanger.ac.uk/research/publications/theses.html|title=Sanger PhD and MPhil theses|url=http://www.sanger.ac.uk/research/publications/theses.html|archivedate=2015-04-07}}</ref>

Versiunea de la 8 mai 2015 12:49

Institutul Sanger al Wellcome Trust
Fișier:Sanger Logo.png
Informații
Fondată1992
Localizare
Țara Regatul Unit
South Cambridgeshire  Modificați la Wikidata
OrașHinxton
Coordonate52°04′39″N 0°11′15″E ({{PAGENAME}}) / 52.0775°N 0.1875°E
Cercetători~900
Prezență web
www.sanger.ac.uk
Modifică date / text Consultați documentația formatului

Institutul Sanger, aparținând Trustului Wellcome este o organizație britanică non-profit, axată pe cercetarea în domeniul geneticii, fondată de Trustul Wellcome. [1]

Institutul Sanger se află în Wellcome Trust Genome Campus, lângă satul numit Hinxton, în apropiere de Cambridge, Marea Britanie. În același campus se află și Institutul European de Bioinformatică. A fost înființat în 1992 sub numele de Centrul Sanger, numit așa după dublul laureat al premiului Nobel Frederick Sanger. [2][3] A fost inițial un centru de dimensiuni mari dedicat secvențializării ADN și a participat în Proiectul „Genomul uman”. Institutul Sanger a avut cea mai mare contribuție unitară la secvențierea genomului uman. De la înființarea sa, institutul duce o politică de data sharing, iar majoritatea proiectelor de cercetare sunt făcute în colaborare cu alte instituții.

Începând cu anul 2000, institutul are ca misiunea și înțelegerea rolului geneticii în stările de sănătate și boală.[4] Institutul are în prezent aproximativ 900 de angajați, care lucrează în patru mari arii de studiu: genetica umană, genetica agenților patogeni, genetica șoarecilor și bioinformatica.

Facililități și resurse

Campus

Wellcome Trust Genome Campus
Vitraliu comemorativ din clădirea Sulston a Institutului Sanger

Wellcome Trust Genome Campus are aproximativ 1300 de angajați, 900 lucrând pentru Institutul Sanger, iar restul lucrând în Institutul European de Bioinformatică.


Secvențiere

Angajații Institutului Sanger lucrează săptămânal cu milioane de mostre de ADN. Institutul folosește tehnologie de ultimă oră pentru a răspunde la întrebări care până acum câțiva ani nu aveau răspuns. [5] Datorită progreselor tehnologiei, Institutul Sanger secvențiază genomurile oamenilor, a altor specii vertebrate și a agenților patogeni, în ritm tot mai mare, și la prețuri tot mai mici. Institutul Sanger secvențiază aproximatix 10 miliarde de baze azotate în fiecare zi. [6]

Resurse științifice

Principalele rezultate ale programelor de cercetare de la Institutul Sanger sunt bazele de date care conțin informații din biologie. Bazele de date întreținute de Institutul Sanger sunt:

Cercetare

Clădirea Morgan (în dreapta), parte a Institutului Sanger

Începând cu anul 2000, Institutul Sanger a investit în secvențiere și a creat noi programe pentru biologia postgenomică - înțelegerea mesajelor din gene . Institutul este implicat în diferite arii de cercetare:

Genetica umană

Institutul se axează pe caracterizarea variației genetice a oamenilor. Pe lângă contribuția la Proiectul „Genomul uman”, cercetătorii de la Institutul Sanger au contribuit la diverse studii legate de îmbolnăvire, genetică comparativă și genetică evolutivă. În ianuarie 2008, lansarea Proiectului celor 1000 de genomuri , proiect la care au colaborat cercetători din toată lumea, a semnalat efortul de a secvenția 1000 de indivizi cu scopul de a crea "cea mai detaliată hartă a variației genetice cu scopul de a înțelege studiile despre îmbolnăvire" .[17] Datele rezultate din proiectele-pilot sunt accesibile gratuit începând cu iunie 2010. [18] În anul 2010, Institutul Sanger și-a anunțat participarea la proiectul UK10K ,[19][20][21] care are ca scop secvențierea genomurilor a 10.000 de indivizi, pentru a identifica variații genetice rare și efectele lor asupra sănătății oamenilor. Institutul Sanger este de asemenea membru al International Cancer Genome Consortium, un proiect internațional care are ca scop descrierea diferitelor tipuri de tumori. [22] De asemenea, Institutul Sanger este membru al programelor de cercetare GENCODE și ENCODE [23] care au ca scop crearea unei enciclopedii a elementelor ADN. [necesită citare]

Organisme de referință

Programele dedicate geneticii șoarecilor și peștilor folosesc secvențele ADN ale acestor organisme de referință pentru a înțelege mecanisme biologice elementare și funcțiile genelor umane. Proiectele includ studiul dezvoltării, cancerului și comportamentului.

Genetica organismelor patogene

Institutul studiză efectele variației genetice în interactiunea dintre gazdă și organismele patogene. Cercetarea de la Institutul Sanger include multe bacterii, viruși și alte organisme patogene.

Bioinformatică

Echipele de bioinformatică de la Institutul Sanger au dezvoltat sisteme IT pentru secvențiere în cercetarea postgenomică. Institutul dezvoltă și menține unelte informatice dedicate analizei ADN, ARN, proteinelor. Cercetătorii din toată lumea pot accesa aceste resurse gratuit pentru a dobândi noi cunoștințe, prin analize asistate de calculator și integrarea datelor.

Programele doctorale și postdoctorale

Institutul are două programe doctorale: un program de 4 ani pentru studenții cu diplomă de licență în șiințe și un program de 3 ani pentru cei diplomă de medici. Programul de 4 ani permite studenților să lucreze în 3 laboratoare diferite pentru a-și lărgi cunoștințele științifice, înaintea începerii programului de doctorat propriu-zis. Fiecare student trebuie șă-și aleagă cel puțin un proiect experimental și cel puțin unul de informatică. [24]

Institutul are aproximativ 50 de studenți la studiile de licență, iar toți sunt înregistrați la Universitatea Cambridge.[25]

  1. ^ „MRC Centre United Kingdom: Wellcome Trust Sanger Institute”. Medical Research Council. Accesat în . 
  2. ^ PMID 24380948 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  3. ^ doi:10.1146/annurev.bi.57.070188.000245
    Această referință va fi completată automat în următoarele minute. Puteți sări peste perioada de așteptare sau puteți extinde citarea manual
  4. ^ „Wellcome Trust Sanger Institute - About us”. Wellcome Trust Sanger Institute. Accesat în . 
  5. ^ „Wellcome Trust Sanger Institute - Sequencing”. Wellcome Trust Sanger Institute. Accesat în . 
  6. ^ Jones, I. „Feature: Highly cited”. Wellcome Trust. Accesat în . 
  7. ^ PMID 25355519 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  8. ^ Eroare la citare: Etichetă <ref> invalidă; niciun text nu a fost furnizat pentru referințele numite decipher
  9. ^ PMID 25352552 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  10. ^ PMID 22116062 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  11. ^ PMID 24157837 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  12. ^ PMID 24288371 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  13. ^ PMID 25392425 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  14. ^ PMID 24194607 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  15. ^ PMID 18003653 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  16. ^ PMID 24194605 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  17. ^ „1000 Genomes: A Deep Catalog of Human Genetic Variation”. 1000 Genomes Project. Accesat în . 
  18. ^ „1000 Genomes Project releases data from pilot projects on path to providing database for 2,500 human genomes”. Wellcome Trust Sanger Institute. Accesat în . 
  19. ^ PMID 24424120 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  20. ^ PMID 24229443 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  21. ^ „Wellcome Trust launches study of 10,000 human genomes in UK”. Wellcome Trust Sanger Institute. Accesat în . 
  22. ^ „International Cancer Genome Consortium Homepage”. International Cancer Genome Consortium. Accesat în . 
  23. ^ „Wellcome Trust Sanger Institute - ENCODE and GENCODE”. Accesat în . 
  24. ^ „Wellcome Trust Sanger Institute PhD Programmes”. Wellcome Trust Sanger Institute. Accesat în . 
  25. ^ „Sanger PhD and MPhil theses”. Arhivat din original la . 
Adus de la https://ro.wikipedia.org/w/index.php?title=Institutul_Sanger&oldid=9456742